Specializzazione dei metodi bioinformatici delle piante

Descrizione

Gli ultimi 15 anni sono stati entusiasmanti per la biologia vegetale. Sono stati sequenziati centinaia di genomi vegetali, l'RNA-seq ha consentito la creazione di profili di espressione a livello di trascrittoma e la proliferazione di metodi basati su "-seq" ha consentito di determinare le interazioni proteina-proteina e proteina-DNA in modo economico e ad alto rendimento maniera. Questi set di dati a loro volta ci consentono di generare ipotesi con un clic del mouse o un tocco di un dito.La specializzazione in bioinformatica vegetale su Coursera introduce le competenze e le risorse bioinformatiche di base, come Genbank dell'NCBI, Blast, allineamenti di sequenze multiple, filogenetica nei metodi bioinformatici I, seguito da interazione proteina-proteina, bioinformatica strutturale e analisi RNA-seq nei metodi bioinformatici II. In Plant Bioinformatics copriamo 33 strumenti online specifici per le piante, dai browser del genoma all'estrazione di dati trascrittomici, alle analisi di promotori / reti e altri. Infine, un Capstone di bioinformatica vegetale utilizza questi strumenti per ipotizzare un ruolo biologico per un gene con funzione sconosciuta, riassunto in un rapporto di laboratorio scritto.Questa specializzazione è utile a qualsiasi biologo molecolare vegetale moderno che voglia avere un'idea dell'incredibile portata dei dati disponibili ai ricercatori. Una piccola quantità di programmazione R è stata introdotta in Bioinformatic Methods II, ma la maggior parte degli strumenti sono applicazioni web. Si consiglia di avere accesso a un computer portatile o desktop per eseguirli poiché potrebbero non funzionare come applicazioni mobili sul telefono o sul tablet.