Metodi bioinformatici I | La rete universitaria

Descrizione

Progetti di biologia su larga scala come il sequenziamento del genoma umano e le indagini sull'espressione genica utilizzando RNA-seq, microarrays e altre tecnologie hanno creato una ricchezza di dati per i biologi. Tuttavia, la sfida che gli scienziati devono affrontare è analizzare e persino accedere a questi dati per estrarre informazioni utili relative al sistema in fase di studio. Questo corso si concentra sull'impiego di risorse bioinformatiche esistenti - principalmente programmi e database basati sul web - per accedere alla ricchezza di dati per rispondere a domande rilevanti per il biologo medio ed è altamente pratico.

Gli argomenti trattati comprendono allineamenti di sequenze multiple, filogenetica, analisi dei dati di espressione genica e reti di interazione proteica, in due parti separate.

La prima parte, Metodi bioinformatici I (questo), tratta di database, Blast, allineamenti di sequenze multiple, filogenetica, analisi di selezione e metagenomica.

La seconda parte, Metodi bioinformatici II, copre la ricerca di motivi, interazioni proteina-proteina, bioinformatica strutturale, analisi dei dati di espressione genica e predizioni di elementi cis.

Questa coppia di corsi è utile a tutti gli studenti che considerano la scuola di specializzazione in scienze biologiche, così come gli studenti che considerano la medicina molecolare. Entrambi forniscono una panoramica dei molti diversi strumenti bioinformatici disponibili.

Questi corsi si basano su quello insegnato presso l'Università di Toronto a studenti universitari di livello superiore che hanno una certa comprensione della biologia molecolare di base. Se non hai familiarità con questo, qualcosa come https://learn.saylor.org/course/bio101 potrebbe essere utile. Non è richiesta alcuna programmazione per questo corso.

Metodi bioinformatici I viene aggiornato regolarmente ed è stato aggiornato l'ultima volta per gennaio 2019.