Descrizione

Gli ultimi 15 anni sono stati entusiasmanti per la biologia vegetale. Sono stati sequenziati centinaia di genomi vegetali, l'RNA-seq ha consentito la creazione di profili di espressione a livello di trascrittoma e la proliferazione di metodi basati su "-seq" ha consentito di determinare le interazioni proteina-proteina e proteina-DNA in modo economico e ad alto rendimento maniera. Questi set di dati a loro volta ci consentono di generare ipotesi con un clic del mouse o con il tocco di un dito.

In Plant Bioinformatics su Coursera.org, abbiamo coperto 33 strumenti online specifici per le piante, dai browser del genoma all'estrazione di dati trascrittomici, alle analisi di promotori / reti e altri, e in questo Capstone di bioinformatica vegetale utilizzeremo questi strumenti per ipotizzare un ruolo biologico gene di funzione sconosciuta, riassunto in un rapporto di laboratorio scritto.

Questo corso fa parte di una specializzazione in bioinformatica vegetale su Coursera, che introduce le competenze e le risorse bioinformatiche di base, come Genbank dell'NCBI, Blast, allineamenti di sequenze multiple, filogenetica nei metodi bioinformatici I, seguita da interazioni proteina-proteina, bioinformatica strutturale e RNA-seq analisi in Metodi Bioinformatici II, oltre ai concetti e agli strumenti specifici della pianta introdotti in Bioinformatica vegetale e Capstone di bioinformatica vegetale.

Questo corso / chiave di volta è stato sviluppato con il finanziamento della Faculty of Arts and Science Open Course Initiative Fund (OCIF) dell'Università di Toronto ed è stato implementato da Eddi Esteban, Will Heikoop e Nicholas Provart. Asher Pasha ha programmato un randomizzatore di ID gene.

Prezzo: Iscriviti gratuitamente!

Capstone della bioinformatica delle piante - Università di Toronto