Evoluzione molecolare (Bioinformatica IV)

Descrizione

Nel corso precedente di Specializzazione, abbiamo imparato a confrontare geni, proteine e genomi. Un modo in cui possiamo usare questi metodi è costruire un "Albero della Vita" che mostri come si è evoluta nel tempo una vasta collezione di organismi correlati.

Nella prima metà del corso, discuteremo degli approcci per la costruzione di alberi evolutivi che sono stati oggetto di alcuni dei documenti scientifici più citati di tutti i tempi e mostreremo come possono risolvere i dilemmi dal trovare l'origine di un virus mortale alla localizzazione il luogo di nascita degli umani moderni.

Nella seconda metà del corso, cambieremo marcia ed esamineremo la vecchia affermazione che gli uccelli si sono evoluti dai dinosauri. Come possiamo provarlo? In particolare, esamineremo un risultato che affermava che i peptidi raccolti da un fossile di T. rex corrispondevano strettamente ai peptidi trovati nei polli. In particolare, utilizzeremo metodi della proteomica computazionale per chiederci come potremmo valutare se questo risultato è valido o dovuto a qualche forma di contaminazione.

Infine, imparerai come applicare i popolari strumenti software di bioinformatica per ricostruire un albero evolutivo di ebolavirus e identificare la fonte della recente epidemia di Ebola che ha causato titoli globali.