Analisi di rete nella biologia dei sistemi

Descrizione

Un'introduzione all'integrazione dei dati e ai metodi statistici utilizzati nella ricerca contemporanea di Biologia dei Sistemi, Bioinformatica e Farmacologia dei Sistemi. Il corso copre i metodi per elaborare dati grezzi da studi sull'espressione di mRNA a livello di genoma (microarrays e RNA-seq) tra cui normalizzazione dei dati, espressione differenziale, clustering, analisi di arricchimento e costruzione di reti. Il corso contiene esercitazioni pratiche per l'utilizzo di strumenti e l'impostazione di pipeline, ma copre anche la matematica alla base dei metodi applicati all'interno degli strumenti. Il corso è principalmente appropriato per studenti laureati principianti e studenti universitari avanzati che si specializzano in settori come biologia, matematica, fisica, chimica, informatica, ingegneria biomedica ed elettrica. Il corso dovrebbe essere utile per i ricercatori che incontrano grandi set di dati nella propria ricerca. Il corso presenta strumenti software sviluppati dal Laboratorio Ma'ayan (http://labs.icahn.mssm.edu/maayanlab/) dalla Icahn School of Medicine sul Monte Sinai, ma anche altri strumenti di analisi e visualizzazione dei dati liberamente disponibili. Lo scopo finale del corso è consentire ai partecipanti di utilizzare i metodi presentati in questo corso per analizzare i propri dati per i propri progetti. Per quei partecipanti che non lavorano sul campo, il corso introduce le attuali sfide di ricerca affrontate nel campo della biologia dei sistemi computazionali.